农村合作医疗不用注销，只要你不再交费就不再享受住院报销。农村养老保险要去注销，去当地社保部门就可以，注销后你交的两年的个人帐户里的钱会退还给你。
以前在农村缴养老保险,现在在单位缴纳,在农村缴的养老保险费该怎么处理
一、城乡居民社保和职工社保怎样处理?
老家那边的社保卡，估计是之前办理城乡居民社保，那边的社保卡中心与银行抢先制卡。一般社保卡，是全省通用（同一个省份，不同地市是通用，只制作一张），你可以在当地社保卡服务中心或者当地社保局官方社保查询网站，查询下，家乡的社保卡在哪个银行，去领卡。或者请求当地社保卡服务中心挂失，重新办理新的社保卡。社保卡有哪些功能，你可以看下下面文章介绍。社保卡有哪些主要功能。
二、村里办的社保怎么退
农民户口的在解除或终止劳动合同后，可以一次性领取。城镇户口不可以领取。由单位到社保办理手续，大约2月后，到单位领取。个人参加社会保险:携带本人身份证户口本(原件复印件)去所在区社保办理单位参加社会保险:携带单位营业执照组织机构代码证法人身份证私企需验资报告单位公章去单位所在区社保开户
三、以前在农村缴养老保险,现在在单位缴纳,在农村缴的养老保险费该怎么处理
如果你属于事业单位的在编人员，也就是享受公务员待遇，那么你的工作关系转移了，可以同时转移养老保险关系，你原来的工龄可以视同企业养老保险的交费年限
